AT1G75930.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.787 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : extracellular lipase 6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of Lipase proteins | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
extracellular lipase 6 (EXL6); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Lipase, GDSL, active site (InterPro:IPR008265), Lipase, GDSL (InterPro:IPR001087); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein (TAIR:AT1G75920.2); Has 3271 Blast hits to 3237 proteins in 176 species: Archae - 0; Bacteria - 214; Metazoa - 0; Fungi - 35; Plants - 3013; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:28508109..28509708 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38598.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 343 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MFRGKIFVLS LFSIYVLSSA AEKNTSFSAL FAFGDSVLDT GNNNFLLTLL KGNYWPYGLS FDYKFPTGRF GNGRVFTDIV AEGLQIKRLV PAYSKIRRIS 101: SEDLKTGVCF ASGGSGIDDL TSRTLRVLSA GDQVKDFKDY LKKLRRVVKR KKKVKEIVSN AVFLISEGNN DLGYFVAPAL LRLQSTTTYT SKMVVWTRKF 201: LKDLYDLGAR KFAVMGVMPV GCLPIHRASF GGVFGWCNFL LNRITEDFNM KLQKGLTSYA VEYDFKDAKF VYVDIYGTLM DLVKNPMAYG FTEAKKACCC 301: MPNAIIPCFH PDKYVFYDFA HPSQKAYEVI SKPIVYQIAK GLA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)