AT1G75680.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glycosyl hydrolase 9B7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
glycosyl hydrolase 9B7 (GH9B7); FUNCTIONS IN: hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds, catalytic activity; INVOLVED IN: carbohydrate metabolic process; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Six-hairpin glycosidase (InterPro:IPR012341), Glycoside hydrolase, family 9, active site (InterPro:IPR018221), Six-hairpin glycosidase-like (InterPro:IPR008928), Glycoside hydrolase, family 9 (InterPro:IPR001701); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glycosyl hydrolase 9B5 (TAIR:AT1G19940.1); Has 1881 Blast hits to 1863 proteins in 273 species: Archae - 2; Bacteria - 718; Metazoa - 187; Fungi - 17; Plants - 915; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 42 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:28417215..28419231 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 57871.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 525 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEEKSKSRGW CGWFIAIIVL ASVILAVVYT VKLRTKKSGD DDGGGPVPGP PGAIDKKYAD ALKLALQFFD IQKSGKLENN KIPWRGDSGL KDGSEDNLDL 101: SKGLYDAGDH IKFGFPMAFT ATVLSWSILE YGDQMNAVNQ LDPAKDSLRW ITDYLIKAHP SDNVLYIQVG DPKVDHPCWE RPEDMKEKRP LTKIDVDTPG 201: TEVAAETAAA MASASLVFKD SDPTYSATLL KHAKQLFNFA DTKRGSYSVN IPEVQKFYNS TGYGDELLWA ASWLYHATED KTYLDYVSNH GKEFASFGNP 301: TWFSWDNKLA GTQVLLSRLL FFKKDLSGSK GLGNYRNTAK AVMCGLLPKS PTSTASRTNG GLIWVSEWNS MQQSVSSAFL ASLFSDYMLT SRIHKISCDG 401: KIFKATELRD FAKSQADYML GKNPLGTSFV VGYGDKYPQF VHHRGASIPA DATTGCLDGF KWFNSTKPNP NIAYGALVGG PFFNETFTDS RENPMQNEPT 501: TYNNALLVGL LSSLVTTSST LQSLK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)