AT1G75020.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.968 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : lysophosphatidyl acyltransferase 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
lysophosphatidyl acyltransferase 4 (LPAT4); FUNCTIONS IN: acyltransferase activity; INVOLVED IN: metabolic process; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phospholipid/glycerol acyltransferase (InterPro:IPR002123); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: lysophosphatidyl acyltransferase 5 (TAIR:AT3G18850.4); Has 2097 Blast hits to 2094 proteins in 638 species: Archae - 0; Bacteria - 957; Metazoa - 532; Fungi - 179; Plants - 135; Viruses - 4; Other Eukaryotes - 290 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:28171779..28173357 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43066.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 378 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEVCGDLKSD NLKNRPLTPL RILRGLMILL VFLSTAFMFL LYFAPIAALG LRLLSVQQSR KVVSLIFGLW LALWPYLFET VNGTTVVFSG DIIPVEKRVL 101: LIANHRTEVD WMYLWNIALR KGCLGYIKYV LKSSLMKLPI FGWGFHVLEF IPVERKREVD EPVLLQMLSS FKDPQEPLWL ALFPEGTDFT EEKCKRSQKF 201: AAEVGLPALS NVLLPKTRGF GVCLEVLHNS LDAVYDLTIA YKPRCPSFMD NVFGTDPSEV HIHVRRVLLK EIPANEAESS AWLMDSFKLK DKLLSDFNAQ 301: GKFPNQRPEE ELSVLKCIAT FAGVISLTVV FIYLTLYSHS CFKVYACLSG TYLTFATYYK FQPSPGCFRE DSCKVKNH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)