AT1G74740.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.966 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : calcium-dependent protein kinase 30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of Calcium Dependent Protein Kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
calcium-dependent protein kinase 30 (CPK30); FUNCTIONS IN: calmodulin-dependent protein kinase activity, protein kinase activity, kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, N-terminal protein myristoylation, abscisic acid mediated signaling pathway; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), EF-Hand 1, calcium-binding site (InterPro:IPR018247), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), EF-hand-like domain (InterPro:IPR011992), Calcium-binding EF-hand (InterPro:IPR002048), EF-hand (InterPro:IPR018248), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), EF-HAND 2 (InterPro:IPR018249), Calcium-dependent protein kinase (InterPro:IPR020642), Calcium/calmodulin-dependent protein kinase-like (InterPro:IPR020636); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: calcium-dependent protein kinase 1 (TAIR:AT1G18890.1); Has 129906 Blast hits to 123880 proteins in 3943 species: Archae - 178; Bacteria - 14335; Metazoa - 48347; Fungi - 17163; Plants - 26785; Viruses - 481; Other Eukaryotes - 22617 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:28080199..28082476 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 61408.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.71 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 541 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGNCIACVKF DPDNSKPNQK KKPPRGRQRN PYDDPDGLRT HAPLRVIPMS HQSQISDKYI LGRELGRGEF GITYLCTDRE TREALACKSI SKRKLRTAVD 101: VEDVRREVTI MSTLPEHPNV VKLKATYEDN ENVHLVMELC EGGELFDRIV ARGHYTERAA ATVARTIAEV VRMCHVNGVM HRDLKPENFL FANKKENSAL 201: KAIDFGLSVL FKPGERFTEI VGSPYYMAPE VLKRNYGPEV DVWSAGVILY ILLCGVPPFW AETEQGVALA ILRGVLDFKR DPWSQISESA KSLVKQMLEP 301: DSTKRLTAQQ VLDHPWIQNA KKAPNVPLGD IVRSRLKQFS MMNRLKKKAL RVIAEHLSIQ EVEVIRNMFT LMDDDNDGKI SYLELRAGLR KVGSQLGEPE 401: IKLLMEVADV NGNGCLDYGE FVAVIIHLQK MENDEHFRQA FMFFDKDGSG YIESEELREA LTDELGEPDN SVIIDIMREV DTDKDGKINY DEFVVMMKAG 501: TDWRKASRQY SRERFKSLSL NLMKDGSMHL HDALTGQSIA V |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)