AT1G74340.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : dolichol phosphate-mannose biosynthesis regulatory protein-related | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
dolichol phosphate-mannose biosynthesis regulatory protein-related; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: macromolecule biosynthetic process; LOCATED IN: integral to endoplasmic reticulum membrane, endomembrane system; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Dolichol phosphate-mannose biosynthesis regulatory (InterPro:IPR009914); Has 224 Blast hits to 224 proteins in 115 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 93; Fungi - 78; Plants - 25; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 28 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:27948288..27948654 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 9056.46 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 80 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
1: MELADRAVGL LLSSISLSIF TYYTFWVIIL PFVDSDHFIH KYFLPQDYAI LVPVFAGIAL LSLISVFIGM VMLKSKKKKA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)