AT1G72000.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.956 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Plant neutral invertase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Plant neutral invertase family protein; FUNCTIONS IN: catalytic activity, beta-fructofuranosidase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Plant neutral invertase (InterPro:IPR006937), Six-hairpin glycosidase-like (InterPro:IPR008928); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Plant neutral invertase family protein (TAIR:AT1G22650.1); Has 697 Blast hits to 694 proteins in 99 species: Archae - 0; Bacteria - 135; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 316; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 246 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:27103277..27105663 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 56794.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 499 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSLSLYDSAH SLDGKSGWDT PVFSMKDSMD RNPMVTEAWE ALCQSQVYFR GKPVGTIAAY DHASEEVLNY DQVFVRDFVP SALAFLMNGE PEIVKNFLLK 101: TLHIQGQDKM IDKFKLGDGA MPASFKVLHN PIKKTDTIIA DFGESAIGRV APVDSGFWWI ILLRAYTKST GDHSLAERPE CQKGMRLILS LCLSEGFDTF 201: PTLLCADGCS MVDRRMGIYG YPIEIQALFF MALRSALSML KHDSEGKEFM EKIVKRLHAL SFHMRSYFWL DFQQLNDIYR YKTEEYSHTA VNKFNVIPDS 301: IPDWIFDFMP LRGGYFVGNV SPARMDFRWF ALGNCIAILS SLATPEQSMA IMDLIEARWE ELVGEMPLKI CYPAMESHEW GIVTGCDPKN TRWSYHNGGS 401: WPVLLWLLTA ASIKTGRPQI ARRAIELAEA RLLKDGWPEY YDGKSGRFIG KQARKSQTWS IAGYLVAKMM MDDPTHVGMI SMEEEKHMKP PLRRSSSWT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)