AT1G71790.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.781 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Subunits of heterodimeric actin filament capping protein Capz superfamily | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Subunits of heterodimeric actin filament capping protein Capz superfamily; FUNCTIONS IN: actin binding; INVOLVED IN: actin cytoskeleton organization; LOCATED IN: F-actin capping protein complex, cytoplasm; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: F-actin capping protein, beta subunit conserved site (InterPro:IPR019771), F-actin capping protein, beta subunit (InterPro:IPR001698); Has 482 Blast hits to 480 proteins in 195 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 232; Fungi - 143; Plants - 34; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 73 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:26996869..26998785 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28878.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 256 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEAALGLLRR MPPKQSETAL SALLSLIPQH SSDLLSQVDL PLQVLRDIES GKDFILCEYN RDADSYRSPW SNKYLPPLED ALYPSSELRK LEVEANDIFA 101: IYRDQYYEGG ISSVYMWEDD NEGFVACFLI KKDGSKSGHG RRGCLEEGAW DAIHVIQVGS EEEEMAQYCL TSTIMLSLTT DDESSGKFGL SGSIRRQMKM 201: ELAVADGHLC NMGRMIEELE GKLRNSLDQV YFGKTREMVC TLRPPAEIVQ MRLPDT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)