AT1G69970.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 ASURE: extracellular What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : CLAVATA3/ESR-RELATED 26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Member of a large family of putative ligands homologous to the Clavata3 gene. Consists of a single exon. Can not replace CLV3 function in vivo. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
CLAVATA3/ESR-RELATED 26 (CLE26); Has 12 Blast hits to 12 proteins in 4 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 12; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:26353900..26354256 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 13631.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 118 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRNNHSLRLQ LWFRTLFTVG VVTLLMIDAF VLQNNKEDDK TKEITTAVNM NNSDAKEIQQ ELEDGSRNDD LSYVASKRKV PRGPDPIHNR FLLLSRFILS 101: LLTNPYPYLH ICVLDVSV |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)