AT1G69920.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.968 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glutathione S-transferase TAU 12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes glutathione transferase belonging to the tau class of GSTs. Naming convention according to Wagner et al. (2002). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glutathione S-transferase TAU 12 (GSTU12); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Glutathione S-transferase, C-terminal-like (InterPro:IPR010987), Glutathione S-transferase/chloride channel, C-terminal (InterPro:IPR017933), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336), Glutathione S-transferase, N-terminal (InterPro:IPR004045); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glutathione S-transferase tau 13 (TAIR:AT1G27130.1); Has 3943 Blast hits to 3928 proteins in 654 species: Archae - 0; Bacteria - 1408; Metazoa - 251; Fungi - 102; Plants - 1945; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 237 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:26334395..26335537 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 27924.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.98 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 254 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLKNKKSDNS LSRDTLQIKK RKKTTMAQNG SNTTVKLIGT WASPFAIRAQ VALHLKSVEH EYVEETDVLK GKSDLLIKSN PIHKKVPVLI HGDVSICESL 101: NIVQYVDESW PSDLSILPTL PSERAFARFW AHFVDGKLFE SIDAVAGAKD DAARMTLAGN LMENLAALEE AFQKSSKGGD FFGGGNIGFV DITVGAIVGP 201: ISVIEAFSGV KFLRPDTTPG LIQWAEKFRA HEAVKPYMPT VAEFIEFAKK KFSV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)