AT1G69720.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : heme oxygenase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member (HO3) of the heme oxygenase family. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
heme oxygenase 3 (HO3); FUNCTIONS IN: heme oxygenase (decyclizing) activity, heme binding; INVOLVED IN: oxidation reduction, heme oxidation; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 20 plant structures; EXPRESSED DURING: 11 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Haem oxygenase-like, multi-helical (InterPro:IPR016084), Haem oxygenase-like (InterPro:IPR016053), Haem oxygenase (decyclizing), plant (InterPro:IPR016951); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Plant haem oxygenase (decyclizing) family protein (TAIR:AT2G26670.1); Has 543 Blast hits to 543 proteins in 142 species: Archae - 0; Bacteria - 177; Metazoa - 122; Fungi - 0; Plants - 114; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 130 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:26227178..26228419 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 32435.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 285 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATTRLNPSC HFPASTRLSC ESYLGLRTTG RISYARTLTA PRGYLAVKAN GGQASVVTAA AITEKQQKKY PGESKGFVEE MRFVAMRLHT KDQAREGEKE 101: SRSPEEGPVA KWEPTVEGYL HFLVDSKLVY DTLEGIIDGS NFPTYAGFKN TGLERAESLR KDLEWFKEQG YEIPEPMAPG KTYSEYLKDL AENDPQAFIC 201: HFYNIYFAHS AGGQMIGTKV SKKILDNKEL EFYKWDGQLS QLLQNVRQKL NKVAEWWTRE EKSHCLEETE KSFKFSGEIL RLILS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)