AT1G69390.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : homologue of bacterial MinE 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an Arabidopsis homologue of the bacterial MinE topological specificity factor ensuring correct division site placement. It is an essential integral component of the plastid division machinery. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
homologue of bacterial MinE 1 (MINE1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Septum formation topological specificity factor MinE (InterPro:IPR005527); Has 203 Blast hits to 203 proteins in 86 species: Archae - 0; Bacteria - 126; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 76; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:26084721..26086284 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25749.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 229 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAMSSGTLRI SATLVSPYHH HHRNRLSLPS SSSKVDFTGF ISNGVNSLET QKCTPGLAIS RENTRGQVKV LARNTGDYEL SPSPAEQEIE SFLYNAINMG 101: FFDRLNLAWK IIFPSHASRR SSNARIAKQR LKMILFSDRC DVSDEAKRKI VNNIIHALSD FVEIESEEKV QLNVSTDGDL GTIYSVTVPV RRVKPEYQDV 201: DEAGTITNVE YKDTRDGSVD VRFDFYVPE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)