AT1G69240.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : methyl esterase 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein predicted to act as a carboxylesterase. It has similarity to the SABP2 methyl salicylate esterase from tobacco but no enzymatic activity has been identified for this protein. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
methyl esterase 15 (MES15); FUNCTIONS IN: hydrolase activity; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: root hair; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Alpha/beta hydrolase fold-1 (InterPro:IPR000073); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: methyl esterase 13 (TAIR:AT1G26360.1); Has 2747 Blast hits to 2746 proteins in 732 species: Archae - 8; Bacteria - 1557; Metazoa - 68; Fungi - 74; Plants - 634; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 405 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:26028115..26030218 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 49331.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 444 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGNSLRCISQ EQDPNQKKPS SVVNGNSSEK HVRRLSLIPS FRRRTLLPSL SCSGSSTSST SKKGGIKTKK KIRERHHQEQ HHHDHEKDSL IQDQTLAATN 101: ILFSQTPRNS NSAPPFRRST SVVYTQPPTA AVAASVGSVS GALTPKKSTY GYVRSSSNRQ RSSTDPVLKP NQLLDKELKV EGAETKRFVL VHGGGFGAWC 201: WYKTITLLEK HGFQVDAVDL TGSGVSSFDT NNITSLAQYV KPLLHFFDTL KPTEKVILVG HDFGGACMSY AMEMYPSKIA KAIFISAAML ANAQSTLDLF 301: NQQPDSNYDL MEQVHLFLYA NGKKNPPTAV DFDRSLLRDF FFNQSPPKDV ALASVSMRPI PFAPVVEKLH VSEKNYGSIR RFYIKTMEDD YAVPVSLQDA 401: MIKSNPPEQV FHLKGSDHAP FFSRPQSLNR ILVEISQLPP KKSS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)