AT1G69190.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Dihydropterin pyrophosphokinase / Dihydropteroate synthase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a bifunctional cytosolic hydroxymethyldihydropterin pyrophosphokinase/ dihydropteroate synthase (HPPK/DHPS)that is involved in tetrahydrofolate biosynthesis and is responsive to oxidative stress. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Dihydropterin pyrophosphokinase / Dihydropteroate synthase; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Dihydropteroate synthase-like (InterPro:IPR011005), 7,8-Dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase, HPPK (InterPro:IPR000550), Dihydropteroate synthase (InterPro:IPR006390), Pterin-binding (InterPro:IPR000489); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Dihydropterin pyrophosphokinase / Dihydropteroate synthase (TAIR:AT4G30000.1); Has 15022 Blast hits to 14981 proteins in 2537 species: Archae - 158; Bacteria - 9759; Metazoa - 8; Fungi - 169; Plants - 69; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4859 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:26013131..26014709 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 54113.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 484 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDFTSLETTT FEEVVIALGS NVGNRMNNFK EALRLMKDYG ISVTRHSCLY ETEPVHVTDQ PRFLNAAIRG VTKLKPHELL NVLKKIEKEM GREENGLRYG 101: PRPLDLDILF YGKHKIISDK LIIPHERIWE RPFVLAPLVD LLGTEDIDND KIVAYWHSLS MHSGGIFQAW ERLGGESLLG KDGIIQRVIP IGDHLWDFSK 201: KTYVMGILNL TPDSFSDGGK FQSVDTAVSR VRSMISEGVD IIDIGAQSTR PMASRISSQE EIDRLIPVLK VVRGMAEMKG KLISVDTFNS EVALEAIRNG 301: ADILNDVSGG SLDENMHKVV ADSDVPYMIM HMRGDPCTMQ NKENLEYNEI CKDVATELYE RVREAELSGI PAWRIMIDPG IGFSKGIDHN LDIVMELPKI 401: REEMAKKSIG LSHAPILIGP SRKRFLGDIC GRPEASERDA ATVACVTAGI LKGANIIRVH NVRDNVDAAR LCDAMMTKRF KNVD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)