AT1G68830.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : STT7 homolog STN7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
STN7 protein kinase; required for state transitions, phosphorylation of the major antenna complex (LHCII) between PSII and PSI, and light adaptation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
STT7 homolog STN7 (STN7); FUNCTIONS IN: protein kinase activity, kinase activity; INVOLVED IN: regulation of photosynthesis, light reaction, circadian rhythm; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cyclin-dependent kinase B1;2 (TAIR:AT2G38620.2); Has 29571 Blast hits to 29413 proteins in 1565 species: Archae - 57; Bacteria - 3753; Metazoa - 11524; Fungi - 3757; Plants - 4496; Viruses - 50; Other Eukaryotes - 5934 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:25872654..25875473 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 63255.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 562 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATISPGGAY IGTPSPFLGK KLKPFSLTSP ILSFKPTVKL NSSCRAQLID TVHNLFIGVG VGLPCTVMEC GDMIYRSTLP KSNGLTITAP GVALALTALS 101: YLWATPGVAP GFFDMFVLAF VERLFRPTFR KDDFVVGKKL GEGSFGVVYK VSLSKKRSNE EGEYVLKKAT EYGAVEIWMN ERVRRACGNS CADFVYGFLD 201: KSSKKGPEYW LLWKYEGEST LAGLMQSKEF PYNVETIILG KVQDLPKGLE RENKIIQTIM RQLLFALDGL HSTGIIHRDV KPQNIIFSEG SRSFKIIDLG 301: AAADLRVGIN YIPKEFLLDP RYAAPEQYIM STQTPSAPSA PVAAALSPVL WQMNLPDRFD IYSIGLIFLQ MAFPSLRSDS NLIQFNRQLK RCDYDLTAWR 401: KLVEPRASAD LRRGFELVDL DGGIGWELLT SMVRYKARQR ISAKAALAHP YFDRQGLLAL SVMQNLRMQY FRATQQDYSE AANWVIQLMA KNGTEKDGGF 501: TETQLQELRE KEPRKKANAQ RNALASALRL QRKLVKTVTE TIDEISDGRK TVWWNRWIPR EE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)