AT1G68760.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : nudix hydrolase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a cytosol-localized nudix hydrolase that hydrolyzes 8-oxo-(d)GTP to its monophosphate form. This protective mechanism prevents the misincorporation of these oxidized nucleotides into DNA and RNA. NUDX1 also has a low level of dihydroneopterin triphosphate pyrophosphatase activity in vitro and may participate in the folate synthesis pathway. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
nudix hydrolase 1 (NUDX1); FUNCTIONS IN: hydrolase activity, dihydroneopterin triphosphate pyrophosphohydrolase activity, 8-oxo-7,8-dihydroguanosine triphosphate pyrophosphatase activity; INVOLVED IN: response to DNA damage stimulus; LOCATED IN: cytosol; EXPRESSED IN: 16 plant structures; EXPRESSED DURING: 10 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NUDIX hydrolase domain-like (InterPro:IPR015797), NUDIX hydrolase (InterPro:IPR020476), NUDIX hydrolase, conserved site (InterPro:IPR020084), NUDIX hydrolase domain (InterPro:IPR000086); Has 6319 Blast hits to 6317 proteins in 1575 species: Archae - 191; Bacteria - 5327; Metazoa - 193; Fungi - 66; Plants - 51; Viruses - 14; Other Eukaryotes - 477 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:25829090..25829607 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 16357.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 147 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSTGEAIPRV AVVVFILNGN SILLGRRRSS IGNSTFALPG GHLEFGESFE ECAAREVMEE TGLKIEKMKL LTVTNNVFKE APTPSHYVSV SIRAVLVDPS 101: QEPKNMEPEK CEGWDWYDWE NLPKPLFWPL EKLFGSGFNP FTHGGGD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)