AT1G68660.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ribosomal protein L12/ ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ribosomal protein L12/ ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS family protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: protein catabolic process; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Adaptor protein ClpS, core (InterPro:IPR003769), Ribosomal protein L7/L12, C-terminal/adaptor protein ClpS-like (InterPro:IPR014719); Has 638 Blast hits to 638 proteins in 172 species: Archae - 0; Bacteria - 350; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 71; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 217 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:25778058..25779083 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 17001.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 159 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: METAICGRLA LAPSSLFNSK SGDKHLVSKG PCVNRSILMT LSTSAALGKG GGVLDKPIIE KTTPGRESEF DLRKSKKIAP PYRVILHNDN FNKREYVVQV 101: LMKVIPGMTV DNAVNIMQEA HINGLAVVIV CAQADAEQHC MQLRGNGLLS SVEPDGGGC |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)