AT1G68590.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ribosomal protein PSRP-3/Ycf65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ribosomal protein PSRP-3/Ycf65; FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: thylakoid, chloroplast thylakoid membrane, chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein PSRP-3/Ycf65 (InterPro:IPR006924); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal protein PSRP-3/Ycf65 (TAIR:AT5G15760.1); Has 390 Blast hits to 390 proteins in 107 species: Archae - 0; Bacteria - 131; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 76; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 183 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:25757593..25758169 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 18473.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.93 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 166 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MMSSMALSST SLCSSFISQH PKLSITASPP LFHTQTTKPI SVKRKIITLA APETLTAETV TGIDTSDNTP QQTIKVVKPD EKSRVVLKFV WMEKNIGLGL 101: DQHVPGHGTI PLSPYFFWPR KDAWEELKST LEAKPWISQK KMIILLNQAT DIINLWQQSG GNLTSQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)