AT1G67550.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.491 golgi 0.361 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : urease | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a nickel-containing urea hydrolase involved in nitrogen recycling. It requires three urease accessory proteins for its activation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
urease (URE); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Urease, alpha subunit (InterPro:IPR005848), Urease, alpha subunit, conserved site (InterPro:IPR017950), Amidohydrolase 1 (InterPro:IPR006680), Urease, alpha/gamma subunit (InterPro:IPR002026), Urease, alpha subunit, core (InterPro:IPR017952), Metal-dependent hydrolase, composite domain (InterPro:IPR011059), Urease, beta subunit (InterPro:IPR002019), Urease (InterPro:IPR008221), Urease, alpha subunit, C-terminal (InterPro:IPR017951), Urease alpha-subunit, N-terminal (InterPro:IPR011612); Has 10097 Blast hits to 10094 proteins in 1139 species: Archae - 93; Bacteria - 7117; Metazoa - 16; Fungi - 228; Plants - 47; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2596 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:25312842..25316911 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 91029.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 838 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKLLPREIEK LELHQAGFLA QKRLARGIRL NYTEAVALIA TQILEFIRDG DKSVAELMDI GRQLLGRRQV LPAVLHLLYT VQVEGTFRDG TKLVTVHEPI 101: SLENGNLELA LHGSFLPVPS LDKFPEVHEG VIIPGDMKYG DGSIIINHGR KAVVLKVVNT GDRPVQVGSH YHFIEVNPLL VFDRRKALGM RLNIPAGTAV 201: RFEPGERKSV VLVNIGGNKV IRGGNGIVDG LVDDVNWTVL METMERRGFK HLEDIDASEG IAGEDPRFTT MISREKYANM YGPTTGDKLR LGDTNLYARI 301: EKDYTVYGDE CVFGGGKVLR EGMGQGIEQA EALSLDTVIT NSVIIDYSGI YKADIGIKNG HIVGIGKAGN PDTMHGVQNN MLIGNKTEVI AGEGMIVTAG 401: AIDCHVHFIC PQLVYEAVSS GITTMVGGGT GPAYGTRATT CTPSPFDMKL MLQSTDSLPL NFGFTGKGNT AKPLELRHIV EAGAMGLKLH EDWGTTPAAI 501: DNCLAVAEEY DIQVNIHTDT LNESGFVEHT INAFRGRTIH TYHSEGAGGG HAPDIIRVCG VKNVLPSSTN PTRPYTKNTV DEHLDMLMVC HHLDKNIPED 601: VAFAESRIRA ETIAAEDILH DMGAISIISS DSQAMGRIGE VISRTWQTAD KMKAQRGAID PNMADDDNSR IKRYIAKYTI NPAIANGFAD LIGSVEVKKL 701: ADLVIWQPAF FGAKPEMIIK GGNIAWANMG DANASIPTPE PVISRPMFGA FGKAGSENSV AFVSKAALRK GVKELYGLKK RVVAVSNVRQ LTKLDMKLND 801: ALPEITVDPE TYVVTANGEV LTCAPADSVP LSRNYFLF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)