AT1G67280.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily protein; FUNCTIONS IN: lactoylglutathione lyase activity, metal ion binding; INVOLVED IN: response to cold, carbohydrate metabolic process; LOCATED IN: thylakoid, thylakoid lumen, stromule, chloroplast, chloroplast stroma; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glyoxalase I (InterPro:IPR004361), Glyoxalase I, conserved site (InterPro:IPR018146), Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase (InterPro:IPR004360); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glyoxalase I homolog (TAIR:AT1G11840.6); Has 8954 Blast hits to 5185 proteins in 1641 species: Archae - 131; Bacteria - 5795; Metazoa - 515; Fungi - 329; Plants - 252; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1932 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:25188563..25190547 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39169.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 350 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVRIIPMAAS SIRPSLACFS DSPRFPISLL SRNLSRTLHV PQSQLFGLTS HKLLRRSVNC LGVAESGKAA QATTQDDLLT WVKNDKRRML HVVYRVGDMD 101: RTIKFYTECL GMKLLRKRDI PEEKYTNAFL GYGPEDSHFV IELTYNYGVD KYDIGAGFGH FGIAVDDVAK TVELVKAKGG KVSREPGPVK GGKTVIAFIE 201: DPDGYKFELL ERGPTPEPLC QVMLRVGDLD RAIKFYEKAF GMELLRTRDN PEYKYTIAMM GYGPEDKFPV LELTYNYGVT EYDKGNAYAQ IAIGTDDVYK 301: TAEAIKLFGG KITREPGPLP GISTKITACL DPDGWKSVFV DNIDFLKELE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)