AT1G66240.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : homolog of anti-oxidant 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
homolog of anti-oxidant 1 (ATX1); FUNCTIONS IN: metal ion binding; INVOLVED IN: metal ion transport; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Heavy metal transport/detoxification protein (InterPro:IPR006121); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: copper chaperone (TAIR:AT3G56240.1); Has 1720 Blast hits to 1673 proteins in 288 species: Archae - 4; Bacteria - 215; Metazoa - 140; Fungi - 221; Plants - 1117; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 23 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:24686445..24687327 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 11430.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 106 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLKDLFQAVS YQNTASLSLF QALSVVESKA MSQTVVLRVA MTCEGCVGAV KRVLGKMEGV ESFDVDIKEQ KVTVKGNVQP DAVLQTVTKT GKKTAFWEAE 101: GETAKA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)