AT1G66070.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Translation initiation factor eIF3 subunit | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Translation initiation factor eIF3 subunit; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Translation initiation factor eIF3 subunit (InterPro:IPR013906); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Translation initiation factor eIF3 subunit (TAIR:AT5G37475.1); Has 512 Blast hits to 510 proteins in 194 species: Archae - 2; Bacteria - 36; Metazoa - 190; Fungi - 147; Plants - 83; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 53 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:24596194..24597520 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25508.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.85 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 226 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDDWEDEKIA PLPAKVELKS NWDDEDVDEN EIKDSWEDDD DEPAQPPVIN PAPEKAPKKA APKTVEKKGK AVEVPKEAPK EKPLDPIAEK LRQQRLVEEA 101: DYRATAELFG VKDDDKNLDM FIPKSESDFL EYAEMISHRI KPYEKSYHYI ALLKTIMRLS LTNMKAADVK DVASSITTIA NEKLKAEKEA AAGKKKGGKK 201: KQLIVDKAND DLVAGPYDAM DDFDFM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)