AT1G65980.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : thioredoxin-dependent peroxidase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
thioredoxin-dependent peroxidase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
thioredoxin-dependent peroxidase 1 (TPX1); FUNCTIONS IN: oxidoreductase activity, antioxidant activity; INVOLVED IN: response to cadmium ion; LOCATED IN: chloroplast, plasma membrane, membrane; EXPRESSED IN: 27 plant structures; EXPRESSED DURING: 16 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Thioredoxin-like (InterPro:IPR017936), Redoxin (InterPro:IPR013740), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: thioredoxin-dependent peroxidase 2 (TAIR:AT1G65970.1); Has 3982 Blast hits to 3982 proteins in 881 species: Archae - 11; Bacteria - 1524; Metazoa - 175; Fungi - 308; Plants - 230; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1734 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:24559524..24560753 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 17428.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 162 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAPIAVGDVV PDGTISFFDE NDQLQTASVH SLAAGKKVIL FGVPGAFTPT CSMKHVPGFI EKAEELKSKG VDEIICFSVN DPFVMKAWGK TYPENKHVKF 101: VADGSGEYTH LLGLELDLKD KGLGVRSRRF ALLLDDLKVT VANVESGGEF TVSSADDILK AL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)