AT1G64710.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : GroES-like zinc-binding dehydrogenase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
GroES-like zinc-binding dehydrogenase family protein; FUNCTIONS IN: oxidoreductase activity, zinc ion binding; INVOLVED IN: oxidation reduction; EXPRESSED IN: 17 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: GroES-like (InterPro:IPR011032), Alcohol dehydrogenase GroES-like (InterPro:IPR013154), Alcohol dehydrogenase, zinc-containing, conserved site (InterPro:IPR002328), Alcohol dehydrogenase, C-terminal (InterPro:IPR013149), Alcohol dehydrogenase superfamily, zinc-containing (InterPro:IPR002085); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: GroES-like zinc-binding dehydrogenase family protein (TAIR:AT1G32780.1); Has 32712 Blast hits to 32690 proteins in 3136 species: Archae - 724; Bacteria - 20870; Metazoa - 1276; Fungi - 2315; Plants - 4127; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 3397 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:24044638..24046313 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43260.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.58 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 396 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQFQLSKPAN NKQRRNMETQ GKVITCKAAV AWGAGEPLVM EDVKVDPPQR LEVRIRILFT SICHTDLSAW KGENEAQRAY PRILGHEAAG IVESVGEGVE 101: EMMAGDHVLP IFTGECGDCR VCKRDGANLC ERFRVDPMKK VMVTDGKTRF FTSKDNKPIY HFLNTSTFSE YTVIDSACVL KVDPLFPLEK ISLLSCGVST 201: GVGAAWNVAD IQPASTVAIF GLGAVGLAVA EGARARGASK IIGIDINPDK FQLGREAGIS EFINPKESDK AVHERVMEIT EGGVEYSFEC AGSIEALREA 301: FLSTNSGVGV TVMLGVHASP QLLPIHPMEL FQGRSITASV FGGFKPKTQL PFFITQCLQG LLNLDLFISH QLPFHDINEA MQLLHQGKAL RCLLHL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)