AT1G64510.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Translation elongation factor EF1B/ribosomal protein S6 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Translation elongation factor EF1B/ribosomal protein S6 family protein; FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome, rRNA binding; INVOLVED IN: translation, ribosome biogenesis; LOCATED IN: thylakoid, chloroplast thylakoid membrane, ribosome, chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Translation elongation factor EF1B/ribosomal protein S6 (InterPro:IPR014717), Ribosomal protein S6 (InterPro:IPR000529); Has 1523 Blast hits to 1523 proteins in 532 species: Archae - 0; Bacteria - 1112; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 36; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 375 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:23954993..23956205 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22762.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.99 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 207 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASSLCVSNS TICPLPNVSS QPLLSFSHSL RPFISKSKPM CASIQKRDGS QFVVKSQALD FSGTFFEGGF GSDDDPTSPS GSGVSTALED KPEPQCPPGL 101: RQYETMAVLR PDMSEDERLG LTQKYEELLV AGGGMYVEVF NRGVIPLAYS IRKKNKAGET NTYLDGIYLL FTYFTKPESI VPLETVLTAD DDIIRSSSFK 201: IKKRKYN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)