AT1G63680.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : acid-amino acid ligases;ligases;ATP binding;ATP binding;ligases | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes AtMurE, a homolog of the bacterial MurE that catalyze the ATP-dependent formation of UDP-N-acetylmuramic acid-tripeptide in bacterial peptidoglycan biosynthesis. Localized to plastids. AtMurE is involved in chloroplast biogenesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
MURE; FUNCTIONS IN: acid-amino acid ligase activity, ATP binding, ligase activity; INVOLVED IN: chloroplast fission, chloroplast organization, biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast, nucleoid; EXPRESSED IN: 18 plant structures; EXPRESSED DURING: 10 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mur ligase, central (InterPro:IPR013221), UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate-2,6-diaminopimelate ligase (InterPro:IPR005761), Mur ligase, N-terminal (InterPro:IPR000713), Mur ligase, C-terminal (InterPro:IPR004101); Has 18234 Blast hits to 18170 proteins in 2587 species: Archae - 50; Bacteria - 13487; Metazoa - 59; Fungi - 43; Plants - 60; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 4533 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:23614461..23617247 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 85591.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 772 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAFTFLSPHP VFLSLTGTTS SFSYKPVLLP FSRNSRTLTV AAGPARRNSY PNPADDDPPE APEDSMHGVS KFQQIQRQAA RARKLEEEDF EKNRNTYLSA 101: IADVEDAAET GRDDEESGGD LFSDIDRAIS MKRSEFVKQG LLKPNPPKTA SLKKIGEEGN EEEGDVTDDV DELDEEEVVD LDEIDKLTGL TEISDEEDWV 201: DEEGNTRINK KKEFGSDHQF EFDLDDFGES KARIVEPKFK MCLAELLDES KVVPISVYGD LDVEITGIQH DSRGVSAGDL FVCCLGSENF LSEADKRGAV 301: AVVASKEIDI EDTLGCRALV IVEDTNAVLA ALASSFYRHP SKNMSVIGVT GTDGKTTTTY LIKSLYEAMG VRTGMFSTVS CYIHGDNKLD TPNATMNPDA 401: VLVQSLMAKM LHNGTESLVM EASPQELALG KCDEVDFDIA VFTNLTRENT DFRGTDEEYR DAEAKLFSRM VDPERHRKVV NIDDPNAAFF VQQGNPNVPV 501: VTFAMENTKA DVHPLKFELS LFETQVLVNT PQGILEISSG LLGRHNIYNI LAAVAVGIAV GAPLEDIVRG VEEVDAVPGR CELIDEEQAF GVIVDHANTP 601: DGLSRLLDSI RELKPRRIIT VIGCEGENER GKRPLMTKIA TEKSDVTMLT SDNPRNEDPL DILDDMLSGI GWTMQEYLKH GEHDYYPPLA NGHRLFLHDI 701: RRVAVRCAVA MGEEGDMVVV AGKGHEAYQL EGEKKEFYDD REECREALQY VDELHQAGID TSEFPWRLPE SH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)