AT1G63440.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.997 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : heavy metal atpase 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
The Arabidopsis P-type ATPase HMA5 is involved in Cu detoxification. hma5 mutant plants exhibit Cu hypersensitivity, which is especially dramatic in roots where HMA5 is mostly expressed. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
heavy metal atpase 5 (HMA5); FUNCTIONS IN: ATPase activity, coupled to transmembrane movement of ions, phosphorylative mechanism; INVOLVED IN: detoxification of copper ion, response to copper ion; LOCATED IN: integral to membrane, membrane; EXPRESSED IN: 8 plant structures; EXPRESSED DURING: L mature pollen stage, M germinated pollen stage, 4 anthesis, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Heavy metal transport/detoxification protein (InterPro:IPR006121), ATPase, P type, cation/copper-transporter (InterPro:IPR006403), ATPase, P-type, ATPase-associated domain (InterPro:IPR008250), Heavy-metal-associated, conserved site (InterPro:IPR017969), Haloacid dehalogenase-like hydrolase (InterPro:IPR005834), ATPase, P-type, K/Mg/Cd/Cu/Zn/Na/Ca/Na/H-transporter (InterPro:IPR001757), ATPase, P-type, heavy metal translocating (InterPro:IPR006416), ATPase, P-type phosphorylation site (InterPro:IPR018303); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: copper-exporting ATPase / responsive-to-antagonist 1 / copper-transporting ATPase (RAN1) (TAIR:AT5G44790.1); Has 47061 Blast hits to 34034 proteins in 3459 species: Archae - 1020; Bacteria - 31793; Metazoa - 4958; Fungi - 2589; Plants - 1873; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 4825 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:23527655..23531109 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 108343.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 995 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATKLLSLTC IRKERFSERY PLVRKHLTRS RDGGGGSSSE TAAFEIDDPI SRAVFQVLGM TCSACAGSVE KAIKRLPGIH DAVIDALNNR AQILFYPNSV 101: DVETIRETIE DAGFEASLIE NEANERSRQV CRIRINGMTC TSCSSTIERV LQSVNGVQRA HVALAIEEAE IHYDPRLSSY DRLLEEIENA GFEAVLISTG 201: EDVSKIDLKI DGELTDESMK VIERSLEALP GVQSVEISHG TDKISVLYKP DVTGPRNFIQ VIESTVFGHS GHIKATIFSE GGVGRESQKQ GEIKQYYKSF 301: LWSLVFTVPV FLTAMVFMYI PGIKDLLMFK VINMLTVGEI IRCVLATPVQ FVIGWRFYTG SYKALRRGSA NMDVLIALGT NAAYFYSLYT VLRAATSPDF 401: KGVDFFETSA MLISFIILGK YLEVMAKGKT SQAIAKLMNL APDTAILLSL DKEGNVTGEE EIDGRLIQKN DVIKIVPGAK VASDGYVIWG QSHVNESMIT 501: GEARPVAKRK GDTVIGGTLN ENGVLHVKVT RVGSESALAQ IVRLVESAQL AKAPVQKLAD RISKFFVPLV IFLSFSTWLA WFLAGKLHWY PESWIPSSMD 601: SFELALQFGI SVMVIACPCA LGLATPTAVM VGTGVGASQG VLIKGGQALE RAHKVNCIVF DKTGTLTMGK PVVVKTKLLK NMVLREFYEL VAATEVNSEH 701: PLAKAIVEYA KKFRDDEENP AWPEACDFVS ITGKGVKATV KGREIMVGNK NLMNDHKVII PDDAEELLAD SEDMAQTGIL VSINSELIGV LSVSDPLKPS 801: AREAISILKS MNIKSIMVTG DNWGTANSIA REVGIDSVIA EAKPEQKAEK VKELQAAGHV VAMVGDGIND SPALVAADVG MAIGAGTDIA IEAADIVLMK 901: SNLEDVITAI DLSRKTFSRI RLNYVWALGY NLMGIPIAAG VLFPGTRFRL PPWIAGAAMA ASSVSVVCCS LLLKNYKRPK KLDHLEIREI QVERV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)