AT1G62640.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : 3-ketoacyl-acyl carrier protein synthase III | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
3-ketoacyl-acyl carrier protein synthase III (KAS III) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
3-ketoacyl-acyl carrier protein synthase III (KAS III); FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring acyl groups other than amino-acyl groups, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: lipid biosynthetic process, metabolic process, fatty acid biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thiolase-like (InterPro:IPR016039), 3-Oxoacyl-[acyl-carrier-protein (ACP)] synthase III C-terminal (InterPro:IPR013747), 3-Oxoacyl-[acyl-carrier-protein (ACP)] synthase III (InterPro:IPR013751), Beta-ketoacyl-acyl carrier protein synthase III (FabH) (InterPro:IPR004655); Has 11800 Blast hits to 11794 proteins in 2811 species: Archae - 187; Bacteria - 7763; Metazoa - 5; Fungi - 2; Plants - 1625; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2218 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:23192502..23194737 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42848.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 404 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MANASGFFTH PSIPNLRSRI HVPVRVSGSG FCVSNRFSKR VLCSSVSSVD KDASSSPSQY QRPRLVPSGC KLIGCGSAVP SLLISNDDLA KIVDTNDEWI 101: ATRTGIRNRR VVSGKDSLVG LAVEAATKAL EMAEVVPEDI DLVLMCTSTP DDLFGAAPQI QKALGCTKNP LAYDITAACS GFVLGLVSAA CHIRGGGFKN 201: VLVIGADSLS RFVDWTDRGT CILFGDAAGA VVVQACDIED DGLFSFDVHS DGDGRRHLNA SVKESQNDGE SSSNGSVFGD FPPKQSSYSC IQMNGKEVFR 301: FAVKCVPQSI ESALQKAGLP ASAIDWLLLH QANQRIIDSV ATRLHFPPER VISNLANYGN TSAASIPLAL DEAVRSGKVK PGHTIATSGF GAGLTWGSAI 401: MRWR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)