AT1G62570.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.401 vacuole 0.355 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : flavin-monooxygenase glucosinolate S-oxygenase 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
belongs to the flavin-monooxygenase (FMO) family, encodes a glucosinolate S-oxygenase that catalyzes the conversion of methylthioalkyl glucosinolates to methylsulfinylalkyl glucosinolates | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
flavin-monooxygenase glucosinolate S-oxygenase 4 (FMO GS-OX4); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Flavin-containing monooxygenase FMO (InterPro:IPR000960), Flavin-containing monooxygenase-like (InterPro:IPR020946); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: flavin-monooxygenase glucosinolate S-oxygenase 2 (TAIR:AT1G62540.1); Has 12978 Blast hits to 12465 proteins in 1535 species: Archae - 27; Bacteria - 6311; Metazoa - 1188; Fungi - 1455; Plants - 842; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3155 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:23169207..23171783 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52461.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 461 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAPAPSPINS QHVAVIGAGA AGLVAARELR REGHTVVVLD REKQVGGLWV YTPETESDEL GLDPTRPIVH SSVYKSLRTN LPRECMGYKD FPFVPRGDDP 101: SRDSRRYPSH REVLAYLQDF ATEFNIEEMI RFETEVLRVE PVNGKWRVQS KTGGGFSNDE IYDAVVMCCG HFAEPNIAQI PGIESWPGRQ THSHSYRVPD 201: PFKDEVVVVI GNFASGADIS RDISKVAKEV HIASRASKSN TFEKRPVPNN NLWMHSEIDT AHEDGTIVFK NGKVVHADTI VHCTGYKYYF PFLETNNYMR 301: VDDNRVEPLY KHIFPPALAP GLSFIGLPAM GLQFYMFEVQ SKWVAAVLSG RVTLPSVDEM MDDLKLSYET QEALGIPKRY THKLGKSQCE YLDWIADLCG 401: FPHVEHWRDQ EVTRGYQRLG NQPETFRDEW DDDDLMEEAY EDFARLNLIN FHPSRFLESG R |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)