AT1G62340.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.896 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : PA-domain containing subtilase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Subtilisin-like serine protease required for epidermal surface formation in embryos and juvenile plants | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ABNORMAL LEAF-SHAPE 1 (ALE1); FUNCTIONS IN: serine-type endopeptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis, cuticle development; LOCATED IN: endomembrane system, cell wall, membrane; EXPRESSED IN: embryo, endosperm; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protease-associated PA (InterPro:IPR003137), Peptidase S8A, DUF1034 C-terminal (InterPro:IPR010435), Peptidase S8/S53, subtilisin/kexin/sedolisin (InterPro:IPR000209), Peptidase S8/S53, subtilisin, active site (InterPro:IPR022398), Proteinase inhibitor I9, subtilisin propeptide (InterPro:IPR010259), Peptidase S8, subtilisin-related (InterPro:IPR015500); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: subtilisin-like serine protease 3 (TAIR:AT2G19170.1); Has 6975 Blast hits to 6033 proteins in 1018 species: Archae - 173; Bacteria - 4150; Metazoa - 21; Fungi - 269; Plants - 1839; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 523 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:23051123..23055656 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 89070.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.83 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 832 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: METNPRKLRS YSYICLIVCI FVLVVCAILS RAEEKEGKGE NDDHIPKIYS ILVEGEPLAF RASTNINSKA MALEAKKIEE IHDEILGSTL EKGSYTKLYS 101: FKHVINAIAV RTTASQAKKL GKTKGVKAVE EDKGVKLMTT YTPDFLELPQ QVWQKISNEG DRRAGEDIVI GFVDTGINPT HPSFAALDLT NPYSSNLSRL 201: HFSGDCEIGP FFPPGSCNGK IISARFFSAG ARASGALNSS LDILSPFDAS GHGSHVASIA AGNAGVPVIV DGFFYGRASG MAPRSRIAVY KAIYPSIGTL 301: VDVIAAIDQA IMDGVDVLTL SVGPDEPPVD KPTVLGIFDL AMLLARKAGV FVVQAVGNNG PSPSSVLSYS PWVVGVAAGN TDRSYPAPLI LDGGQTVQGV 401: GLSGPTLGAP LVQHRLVLAK DAVRTNGSVL QPLTRDIEEC QRPENFDPAA VFGSIVICTF SDGFYNQMST VLAITQTART LGFMGFILIA NPRFGDYVAE 501: PVIFSAPGIL IPTVSAAQII LRYYEEKTFR DTRGVATQFG ARARIGEGRN SVFAGKAPVV SRFSSRGPAF IDATRSPLDV LKPDILAPGH QIWGAWSLPS 601: AFDPILTGRS FAILSGTSMA TPHIAGIGAL IKQLNPSWTP AMIASAISTT ANEYDSNGEI ISAEYYELSR LFPSNHFDHG AGHVNPARAL DPGLVLPAGF 701: EDYISFLCSL PNISPATIRD ATGVLCTTTL SHPANLNHPS VTISALKESL VVRRSFQDVS NKTETYLGSV LPPNGTTVRL TPTWFTVPPQ KTQDLDIEFN 801: VTQVLNKFTF GEVVLTGSLN HIIRIPLSVK TI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)