AT1G62180.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : 5'adenylylphosphosulfate reductase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a adenosine 5'-phosphosulfate reductase, involved in sulfate assimilation. Is a major effect locus for natural variation of shoot sulfate content in Arabidopsis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
5'adenylylphosphosulfate reductase 2 (APR2); FUNCTIONS IN: adenylyl-sulfate reductase activity, phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin) activity; INVOLVED IN: sulfate assimilation, phosphoadenylyl sulfate reduction by phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin), sulfate assimilation; LOCATED IN: chloroplast stroma, chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold (InterPro:IPR014729), Thioredoxin-independent 5'-adenylylsulphate reductase (InterPro:IPR004508), Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Phosphoadenosine phosphosulphate reductase (InterPro:IPR002500), Thioredoxin-like (InterPro:IPR017936), Thioredoxin domain (InterPro:IPR013766), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: APS reductase 3 (TAIR:AT4G21990.1); Has 5381 Blast hits to 4904 proteins in 1602 species: Archae - 157; Bacteria - 2618; Metazoa - 1060; Fungi - 451; Plants - 490; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 605 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:22975794..22977465 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50658.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.86 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 454 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MALAVTSSST AISGSSFSRS GASSESKALQ ICSIRLSDRT HLSQRRYSMK PLNAESHSRS ESWVTRASTL IAPEVEEKGG EVEDFEQLAK KLEDASPLEI 101: MDKALERFGD QIAIAFSGAE DVALIEYARL TGKPFRVFSL DTGRLNPETY RLFDAVEKQY GIRIEYMFPD AVEVQALVRN KGLFSFYEDG HQECCRVRKV 201: RPLRRALKGL KAWITGQRKD QSPGTRSEIP IVQVDPVFEG LDGGVGSLVK WNPLANVEGA DVWNFLRTMD VPVNALHAQG YVSIGCEPCT RPVLPGQHER 301: EGRWWWEDAK AKECGLHKGN IKEEDGAADS KPAAVQEIFE SNNVVALSKG GVENLLKLEN RKEAWLVVLY APWCPFCQAM EASYIELAEK LAGKGVKVAK 401: FRADGEQKEF AKQELQLGSF PTILLFPKRA PRAIKYPSEH RDVDSLMSFV NLLR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)