AT1G58360.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : amino acid permease 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes AAP1 (amino acid permease 1), a neutral amino acid transporter expressed in seeds. Functions in amino acid uptake into embryos. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
amino acid permease 1 (AAP1); FUNCTIONS IN: neutral amino acid transmembrane transporter activity, amino acid transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: neutral amino acid transport, amino acid import, response to nematode; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Amino acid transporter, transmembrane (InterPro:IPR013057); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: amino acid permease 8 (TAIR:AT1G10010.1); Has 2298 Blast hits to 2282 proteins in 214 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 416; Fungi - 417; Plants - 1313; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 152 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:21676623..21680313 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52898.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.96 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 485 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKSFNTEGHN HSTAESGDAY TVSDPTKNVD EDGREKRTGT WLTASAHIIT AVIGSGVLSL AWAIAQLGWI AGTSILLIFS FITYFTSTML ADCYRAPDPV 101: TGKRNYTYMD VVRSYLGGRK VQLCGVAQYG NLIGVTVGYT ITASISLVAV GKSNCFHDKG HTADCTISNY PYMAVFGIIQ VILSQIPNFH KLSFLSIMAA 201: VMSFTYATIG IGLAIATVAG GKVGKTSMTG TAVGVDVTAA QKIWRSFQAV GDIAFAYAYA TVLIEIQDTL RSSPAENKAM KRASLVGVST TTFFYILCGC 301: IGYAAFGNNA PGDFLTDFGF FEPFWLIDFA NACIAVHLIG AYQVFAQPIF QFVEKKCNRN YPDNKFITSE YSVNVPFLGK FNISLFRLVW RTAYVVITTV 401: VAMIFPFFNA ILGLIGAASF WPLTVYFPVE MHIAQTKIKK YSARWIALKT MCYVCLIVSL LAAAGSIAGL ISSVKTYKPF RTMHE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)