AT1G58290.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Glutamyl-tRNA reductase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with glutamyl-tRNA reductase (GluTR) activity, catalyzing the NADPH-dependent reduction of Glu-tRNA(Glu) to glutamate 1-semialdehyde (GSA) with the release of free tRNA(Glu). It is involved in the early steps of chlorophyll biosynthesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
HEMA1; FUNCTIONS IN: glutamyl-tRNA reductase activity; INVOLVED IN: chlorophyll biosynthetic process, heme biosynthetic process, response to light stimulus, porphyrin biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Quinate/shikimate 5-dehydrogenase/glutamyl-tRNA reductase (InterPro:IPR006151), Tetrapyrrole biosynthesis, glutamyl-tRNA reductase, conserved site (InterPro:IPR018214), Tetrapyrrole biosynthesis, glutamyl-tRNA reductase, C-terminal (InterPro:IPR015896), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040), Tetrapyrrole biosynthesis, glutamyl-tRNA reductase (InterPro:IPR000343), Tetrapyrrole biosynthesis, glutamyl-tRNA reductase, N-terminal (InterPro:IPR015895); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Glutamyl-tRNA reductase family protein (TAIR:AT1G09940.1); Has 5070 Blast hits to 5064 proteins in 1817 species: Archae - 226; Bacteria - 3676; Metazoa - 1; Fungi - 0; Plants - 227; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 940 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:21624028..21626051 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 59518.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.91 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 543 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAVSSAFVGC PKLETLLNHH NLSPSSSSSS SVSQTPLGLN GVRVLPKNNR TRRGLIQKAR CELSASSDSA SNAASISALE QLKNSAADRY TKERSSIVVI 101: GLSIHTAPVE MREKLAIPEA EWPRAIAELC GLNHIEEAAV LSTCNRMEIY VLALSQHRGV KEVTEWMSKT SGIPVSEICQ HRFLLYNKDA TQHIFEVSAG 201: LDSLVLGEGQ ILAQVKQVVK VGQGVNGFGR NISGLFKHAI TVGKRVRTET NIASGAVSVS SAAVELALMK LPQSSNVSAR MCVIGAGKMG KLVIKHLMAK 301: GCTKVVVVNR SEERVSAIRE EMPGIEIIYR PLDEMLACAS EADVVFTSTA SETPLFLKEH VENLPQASPE VGGLRHFVDI SVPRNVGSCV GEVETARVYN 401: VDDLKEVVAA NKEDRMRKAM EAQTIITEES TQFEAWRDSL ETVPTIKKLR AYAERIRVAE LEKCMSKMGD DINKKTTRAV DDLSRGIVNR FLHGPMQHLR 501: CDGSDSRTLS ETLENMHALN RMYGLEKDIL EEKLKAMAEQ QQK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)