AT1G56430.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.986 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : nicotianamine synthase 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with nicotianamine synthase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
nicotianamine synthase 4 (NAS4); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Nicotianamine synthase (InterPro:IPR004298); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nicotianamine synthase 3 (TAIR:AT1G09240.1); Has 205 Blast hits to 202 proteins in 47 species: Archae - 24; Bacteria - 12; Metazoa - 0; Fungi - 20; Plants - 147; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:21137023..21137997 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36353.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.91 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 324 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGYCQDDQLV NKICDLYEKI SKLETLKPCE DVDTLFKQLV STCIPPNPNI DVTKMSENIQ EMRSNLIKIC GEAEGYLEHH FSSILTSFED NPLHHLNLFP 101: YYNNYLKLSK LEFDLLEQNL NGFVPRTVAF IGSGPLPLTS VVLASSHLKD SIFHNFDIDP SANMVAARLV SSDPDLSQRM FFHTVDIMDV TESLKGFDVV 201: FLAALVGMDK KEKVKVVEHL EKHMSPGALL MLRSAHGPRA FLYPIVEPCD LEGFEVLSVY HPTDEVINSI VISRKLGEDA NGVVHDHIDQ ASDLACNCSK 301: IHVIMNKKKS IIEEFAGANE EQLT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)