AT1G54580.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : acyl carrier protein 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes an acyl carrier protein expressed in leaves, roots, and dry seeds. Gene expression is not regulated by light but downregulated by starvation and upregulated by increased level of exogenous sucrose. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
acyl carrier protein 2 (ACP2); FUNCTIONS IN: acyl carrier activity; INVOLVED IN: fatty acid biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED DURING: seedling growth; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phosphopantetheine-binding (InterPro:IPR006163), Acyl carrier protein (ACP) (InterPro:IPR003231), Acyl carrier protein-like (InterPro:IPR009081), Phosphopantetheine attachment site (InterPro:IPR006162); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: acyl carrier protein 3 (TAIR:AT1G54630.1); Has 6585 Blast hits to 6585 proteins in 2202 species: Archae - 0; Bacteria - 4416; Metazoa - 36; Fungi - 108; Plants - 352; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 1671 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:20389572..20390770 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 14528.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 136 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASIAASASI SLQARPRQLA IAASQVKSFS NGRRSSLSFN LRQLPTRLTV SCAAKPETVD KVCAVVRKQL SLKEADEITA ATKFAALGAD SLDTVEIVMG 101: LEEEFGIEMA EEKAQSIATV EQAAALIEEL LFEKAK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)