AT1G54500.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Rubredoxin-like superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Rubredoxin-like superfamily protein; FUNCTIONS IN: electron carrier activity, metal ion binding; LOCATED IN: chloroplast thylakoid membrane, chloroplast; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Rubredoxin, iron-binding site (InterPro:IPR018527), Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein (InterPro:IPR004039); Has 3108 Blast hits to 3080 proteins in 1023 species: Archae - 186; Bacteria - 2587; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 52; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 283 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:20357084..20357671 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 21875.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 195 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASATFSFCP LSQSHPHSSL IKPTPFLRYG KKLHHLHHHI FITISYPSHH SRYLAVSRDD AATPLSSSDQ TQETETKEVE DTIEKRRMEE KFAVLNTGIY 101: ECRSCGYKYD ESAGDPSYPI PPGFQFDKLP EDWRCPTCGA AQSFFESKMV EIAGFAQNQQ YGLGGNALTS GQKTGLIFGS LLLFFALFLS GYFIQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)