AT1G54100.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : aldehyde dehydrogenase 7B4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Aldehyde dehydrogenase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
aldehyde dehydrogenase 7B4 (ALDH7B4); FUNCTIONS IN: 3-chloroallyl aldehyde dehydrogenase activity, oxidoreductase activity; INVOLVED IN: response to desiccation, response to salt stress, response to abscisic acid stimulus; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aldehyde/histidinol dehydrogenase (InterPro:IPR016161), Aldehyde dehydrogenase (InterPro:IPR015590), Aldehyde dehydrogenase, N-terminal (InterPro:IPR016162), Aldehyde dehydrogenase, conserved site (InterPro:IPR016160); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: aldehyde dehydrogenase 5F1 (TAIR:AT1G79440.1); Has 58805 Blast hits to 58641 proteins in 2995 species: Archae - 475; Bacteria - 35443; Metazoa - 2491; Fungi - 2112; Plants - 1217; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 17067 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:20195435..20198853 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 54211.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 508 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGSANNEYEF LSEIGLTSHN LGSYVAGKWQ ANGPLVSTLN PANNQPIAQV VEASLEDYEQ GLKACEEAAK IWMQVTAPKR GDIVRQIGDA LRSKLDYLGR 101: LLSLEMGKIL AEGIGEVQEV IDMCDFAVGL SRQLNGSVIP SERPNHMMLE MWNPLGIVGV ITAFNFPCAV LGWNACIALV CGNCVVWKGA PTTPLITIAM 201: TKLVAEVLEK NNLPGAIFTA MCGGAEIGEA IAKDTRIPLV SFTGSSRVGS MVQQTVNARS GKTLLELSGN NAIIVMDDAD IQLAARSVLF AAVGTAGQRC 301: TTCRRLLLHE SVYDKVLEQL LTSYKQVKIG NPLEKGTLLG PLHTPESKKN FEKGIEVIKS QGGKILTGGK AVEGEGNFVE PTIIEISADA AVVKEELFAP 401: VLYVLKFKSF GEAVAINNSV PQGLSSSIFT RNPENIFRWI GPLGSDCGIV NVNIPTNGAE IGGAFGGEKA TGGGREAGSD SWKQYMRRST CTINYGNELP 501: LAQGINFG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)