AT1G50940.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : electron transfer flavoprotein alpha | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes the electron transfer flavoprotein ETF alpha, a putative subunit of the mitochondrial electron transfer flavoprotein complex (ETF beta is At5g43430.1) in Arabidopsis. Mutations of the ETF beta gene results in accelerated senescence and early death compared to wild-type during extended darkness. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
electron transfer flavoprotein alpha (ETFALPHA); FUNCTIONS IN: copper ion binding; LOCATED IN: mitochondrion; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Electron transfer flavoprotein, alpha subunit, C-terminal (InterPro:IPR014731), Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold (InterPro:IPR014729), Electron transfer flavoprotein, alpha/beta-subunit, N-terminal (InterPro:IPR014730), Electron transfer flavoprotein, alpha subunit (InterPro:IPR001308), Electron transfer flavoprotein, alpha subunit, C-terminal, conserved site (InterPro:IPR018206); Has 7540 Blast hits to 7533 proteins in 1658 species: Archae - 158; Bacteria - 4517; Metazoa - 162; Fungi - 143; Plants - 45; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2515 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:18878038..18879939 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38410.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.93 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 363 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTRTVLLRAL TKNKFVASNA PRSISISITS LSRCISTLIL AEHESGTIKP QTVSTVVAAN SLGESSSISL LLAGSGSSLQ EAASQAASCH PSVSEVLVAD 101: SDKFEYSLAE PWAKLVDFVR QQGDYSHILA SSSSFGKNIL PRVAALLDVS PITDVVKILG SDQFIRPIYA GNALCTVRYT GAGPCMLTIR STSFPVTPIT 201: ANSESKKATV SQIDLSNFED DSVSKSRYVG RSTQDTERPD LGSARVVITG GRALKSVENF KMIEKLAEKL GGAVGATRAA VDAGYVPNDL QVGQTGKIVA 301: PELYMAFGVS GAIQHLAGIK DSKVIVAVNK DADAPIFQVA DYGLVGDLFE VIPELLEKLP EKK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)