AT1G50920.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.978 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Nucleolar GTP-binding protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Nucleolar GTP-binding protein; FUNCTIONS IN: GTP binding, nucleotide binding; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: GTP1/OBG (InterPro:IPR006073), Nucleolar GTP-binding 1 (InterPro:IPR010674), NOG, C-terminal (InterPro:IPR012973); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Nucleolar GTP-binding protein (TAIR:AT1G10300.1); Has 9379 Blast hits to 9179 proteins in 2035 species: Archae - 370; Bacteria - 5195; Metazoa - 1143; Fungi - 469; Plants - 325; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1877 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:18870555..18872570 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 76853.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 671 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVQYNFKRIT VVPNGKEFVD IILSRTQRQT PTVVHKGYKI NRLRQFYMRK VKYTQTNFHA KLSAIIDEFP RLEQIHPFYG DLLHVLYNKD HYKLALGQVN 101: TARNLISKIS KDYVKLLKYG DSLYRCKCLK VAALGRMCTV LKRITPSLAY LEQIRQHMAR LPSIDPNTRT VLICGYPNVG KSSFMNKVTR ADVDVQPYAF 201: TTKSLFVGHT DYKYLRYQVI DTPGILDRPF EDRNIIEMCS ITALAHLRAA VLFFLDISGS CGYTIAQQAA LFHSIKSLFM NKPLVIVCNK TDLMPMENIS 301: EEDRKLIEEM KSEAMKTAMG ASEEQVLLKM STLTDEGVMS VKNAACERLL DQRVEAKMKS KKINDHLNRF HVAIPKPRDS IERLPCIPQV VLEAKAKEAA 401: AMEKRKTEKD LEEENGGAGV YSASLKKNYI LQHDEWKEDI MPEILDGHNV ADFIDPDILQ RLAELEREEG IREAGVEEAD MEMDIEKLSD EQLKQLSEIR 501: KKKAILIKNH RLKKTVAQNR STVPRKFDKD KKYTTKRMGR ELSAMGLDPS SAMDRARSKS RGRKRDRSED AGNDAMDVDD EQQSNKKQRV RSKSRAMSIS 601: RSQSRPPAHE VVPGEGFKDS TQKLSAIKIS NKSHKKRDKN ARRGEADRVI PTLRPKHLFS GKRGKGKTDR R |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)