AT1G49820.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-methyl-5-thioribose kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes 5-methylthioribose kinase, involved in methionine cycle | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
S-methyl-5-thioribose kinase (MTK); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Methylthioribose kinase (InterPro:IPR009212), Aminoglycoside phosphotransferase (InterPro:IPR002575), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009); Has 954 Blast hits to 954 proteins in 299 species: Archae - 0; Bacteria - 750; Metazoa - 4; Fungi - 0; Plants - 63; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 137 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:18443005..18444907 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 48073.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.48 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 420 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSFEEFTPLN EKSLVDYIKS TPALSSKIGA DKSDDDLVIK EVGDGNLNFV FIVVGSSGSL VIKQALPYIR CIGESWPMTK ERAYFEATTL RKHGNLSPDH 101: VPEVYHFDRT MALIGMRYLE PPHIILRKGL IAGIEYPFLA DHMSDYMAKT LFFTSLLYHD TTEHRRAVTE FCGNVELCRL TEQVVFSDPY RVSTFNRWTS 201: PYLDDDAKAV REDSALKLEI AELKSMFCER AQALIHGDLH TGSVMVTQDS TQVIDPEFSF YGPMGFDIGA YLGNLILAFF AQDGHATQEN DRKEYKQWIL 301: RTIEQTWNLF NKRFIALWDQ NKDGPGEAYL ADIYNNTEVL KFVQENYMRN LLHDSLGFGA AKMIRRIVGV AHVEDFESIE EDKRRAICER SALEFAKMLL 401: KERRKFKSIG EVVSAIQQQS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)