AT1G35670.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : calcium-dependent protein kinase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a Ca(2+)-dependent, calmodulin-independent protein kinase that is rapidly induced by drought and high-salt stress but not by low-temperature stress or heat stress. Positive regulator of ABA signaling. Phosphorylates ABA responsive transcription factors ABF1 and ABF4. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
calcium-dependent protein kinase 2 (CDPK2); FUNCTIONS IN: calmodulin-dependent protein kinase activity, kinase activity; INVOLVED IN: response to water deprivation, response to salt stress, protein amino acid phosphorylation, positive regulation of abscisic acid mediated signaling pathway; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), EF-Hand 1, calcium-binding site (InterPro:IPR018247), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), EF-hand-like domain (InterPro:IPR011992), Calcium-binding EF-hand (InterPro:IPR002048), EF-hand (InterPro:IPR018248), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), EF-HAND 2 (InterPro:IPR018249), Calcium-dependent protein kinase (InterPro:IPR020642), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635), Calcium/calmodulin-dependent protein kinase-like (InterPro:IPR020636); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: calcium-dependent protein kinase 4 (TAIR:AT4G09570.1); Has 134131 Blast hits to 125244 proteins in 4234 species: Archae - 175; Bacteria - 14420; Metazoa - 49980; Fungi - 18055; Plants - 27559; Viruses - 606; Other Eukaryotes - 23336 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:13205456..13208058 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 55919.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 495 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: METKPNPRRP SNTVLPYQTP RLRDHYLLGK KLGQGQFGTT YLCTEKSTSA NYACKSIPKR KLVCREDYED VWREIQIMHH LSEHPNVVRI KGTYEDSVFV 101: HIVMEVCEGG ELFDRIVSKG HFSEREAVKL IKTILGVVEA CHSLGVMHRD LKPENFLFDS PKDDAKLKAT DFGLSVFYKP GQYLYDVVGS PYYVAPEVLK 201: KCYGPEIDVW SAGVILYILL SGVPPFWAET ESGIFRQILQ GKLDFKSDPW PTISEAAKDL IYKMLERSPK KRISAHEALC HPWIVDEQAA PDKPLDPAVL 301: SRLKQFSQMN KIKKMALRVI AERLSEEEIG GLKELFKMID TDNSGTITFE ELKAGLKRVG SELMESEIKS LMDAADIDNS GTIDYGEFLA ATLHMNKMER 401: EENLVAAFSY FDKDGSGYIT IDELQSACTE FGLCDTPLDD MIKEIDLDND GKIDFSEFTA MMRKGDGVGR SRTMMKNLNF NIADAFGVDG EKSDD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)