AT1G35230.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 ASURE: extracellular What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : arabinogalactan protein 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes arabinogalactan-protein (AGP5). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
arabinogalactan protein 5 (AGP5); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: arabinogalactan protein 10 (TAIR:AT4G09030.1); Has 52009 Blast hits to 24079 proteins in 1500 species: Archae - 200; Bacteria - 14022; Metazoa - 11286; Fungi - 4612; Plants - 7669; Viruses - 1962; Other Eukaryotes - 12258 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:12917184..12917585 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 12597.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 133 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASKSVVVFL FLALVASSVV AQAPGPAPTI SPLPATPTPS QSPRATAPAP SPSANPPPSA PTTAPPVSQP PTESPPAPPT STSPSGAPGT NVPSGEAGPA 101: QSPLSGSPNA AAVSRVSLVG TFAGVAVIAA LLL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)