AT1G33030.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.478 cytosol 0.266 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : O-methyltransferase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
O-methyltransferase family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Winged helix-turn-helix transcription repressor DNA-binding (InterPro:IPR011991), Plant methyltransferase dimerisation (InterPro:IPR012967), O-methyltransferase, family 2 (InterPro:IPR001077), O-methyltransferase, COMT, eukaryota (InterPro:IPR016461); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: O-methyltransferase 1 (TAIR:AT5G54160.1); Has 3271 Blast hits to 3267 proteins in 582 species: Archae - 5; Bacteria - 904; Metazoa - 97; Fungi - 600; Plants - 1551; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 114 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:11964885..11966212 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38969.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 352 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEEQNLSSYA MILSSSSVLP MVLKTAIDLG LFDILAESGP SSASQIFSLL SNETKKHHDS SLVNRILRFL ASYSILTCSV STEHGEPFAI YGLAPVAKYF 101: TKNQNGGGSL APMVNLFQDK VVTDMWYNLK DSVLEGGLPF NNTHGSSAVE LVGSDSRFRE VFQSSMKGFN EVFIEEFLKN YNGFDGVKSL VDVGGGDGSL 201: LSRIISKHTH IIKAINFDLP TVINTSLPSP GIEHVAGDMF TNTPKGEAIF MKWMLHSWDD DHCVKILSNC YQSLPSNGKV IVVDMVIPEF PGDTLLDRSL 301: FQFELFMMNM NPSGKERTKK EFEILARLAG FSNVQVPFTS LCFSVLEFHK NK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)