AT1G32440.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : plastidial pyruvate kinase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a chloroplast pyruvate kinase beta subunit. The enzyme is less active than the other chloroplast pyruvate kinase beta subunit encoded by AT5G52920. Involved in seed oil biosynthesis. Can partially complement the AT5G52920 mutant. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
plastidial pyruvate kinase 3 (PKp3); FUNCTIONS IN: pyruvate kinase activity; INVOLVED IN: glycolysis, fatty acid biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast stroma, chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyruvate kinase, C-terminal-like (InterPro:IPR015795), Pyruvate kinase, active site (InterPro:IPR018209), Pyruvate kinase, beta-barrel-like (InterPro:IPR011037), Pyruvate kinase, alpha/beta (InterPro:IPR015794), Pyruvate/Phosphoenolpyruvate kinase, catalytic core (InterPro:IPR015813), Pyruvate kinase (InterPro:IPR001697), Pyruvate kinase, barrel (InterPro:IPR015793); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: plastidic pyruvate kinase beta subunit 1 (TAIR:AT5G52920.1); Has 10210 Blast hits to 10148 proteins in 2685 species: Archae - 173; Bacteria - 5966; Metazoa - 531; Fungi - 219; Plants - 532; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2789 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:11712205..11714963 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 62618.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.91 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 571 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAAYGQISSG MTVDPQVLSS SRNIGVSLSP LRRTLIGAGV RSTSISLRQC SLSVRSIKIS EDSRKPKAYA ENGAFDVGVL DSSSYRLADS RTSSNDSRRK 101: TKIVCTIGPS SSSREMIWKL AEAGMNVARL NMSHGDHASH QITIDLVKEY NSLFVDKAIA IMLDTKGPEV RSGDVPQPIF LEEGQEFNFT IKRGVSLKDT 201: VSVNYDDFVN DVEVGDILLV DGGMMSLAVK SKTSDLVKCV VIDGGELQSR RHLNVRGKSA TLPSITDKDW EDIKFGVDNQ VDFYAVSFVK DAKVVHELKN 301: YLKTCSADIS VIVKIESADS IKNLPSIISA CDGAMVARGD LGAELPIEEV PLLQEEIIRR CRSIHKPVIV ATNMLESMIN HPTPTRAEVS DIAIAVREGA 401: DAIMLSGETA HGKFPLKAVN VMHTVALRTE ASLPVRTSAS RTTAYKGHMG QMFAFHASIM ANTLSSPLIV FTRTGSMAVL LSHYRPSATI FAFTNQRRIM 501: QRLALYQGVM PIYMEFSDDA EDTYARSLKL LQDENMLKEG QHVTLVQSGS QPIWREESTH LIQVRKIKIG G |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)