AT1G32350.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : alternative oxidase 1D | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
alternative oxidase 1D (AOX1D); FUNCTIONS IN: alternative oxidase activity; INVOLVED IN: oxidation reduction, response to cyclopentenone; LOCATED IN: mitochondrial envelope, mitochondrion; EXPRESSED IN: stem, sepal, leaf, stamen; EXPRESSED DURING: LP.04 four leaves visible, 4 anthesis, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Alternative oxidase (InterPro:IPR002680); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: alternative oxidase 1A (TAIR:AT3G22370.1); Has 1297 Blast hits to 1297 proteins in 245 species: Archae - 0; Bacteria - 109; Metazoa - 12; Fungi - 194; Plants - 377; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 605 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:11667237..11668569 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36204.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.87 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 318 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSYRSIYRTL RPVLSSSVQS SGLGIGGFRG HLISHLPNVR LLSSDTSSPV SGNNQPENPI RTADGKVIST YWGIPPTKIT KPDGSAWKWN CFQPWDSYKP 101: DVSIDVTKHH KPSNFTDKFA YWTVQTLKIP VQLFFQRKHM CHAMLLETVA AVPGMVGGML LHLKSLRRFE HSGGWIKALL EEAENERMHL MTFIELSQPK 201: WYERAIVFTV QGVFFNAYFL AYVISPKLAH RITGYLEEEA VNSYTEFLKD IDAGKFENSP APAIAIDYWR LPKDATLRDV VYVIRADEAH HRDINHYASD 301: IQFKGHELKE APAPIGYH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)