AT1G31800.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome P450, family 97, subfamily A, polypeptide 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with β-ring carotenoid hydroxylase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome P450, family 97, subfamily A, polypeptide 3 (CYP97A3); FUNCTIONS IN: carotene beta-ring hydroxylase activity, oxygen binding; INVOLVED IN: carotenoid biosynthetic process, xanthophyll biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cytochrome P450 superfamily protein (TAIR:AT3G53130.1); Has 33118 Blast hits to 32966 proteins in 1677 species: Archae - 61; Bacteria - 4341; Metazoa - 11636; Fungi - 7136; Plants - 8575; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 1366 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:11396440..11399470 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 66849.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 595 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAMAFPLSYT PTITVKPVTY SRRSNFVVFS SSSNGRDPLE ENSVPNGVKS LEKLQEEKRR AELSARIASG AFTVRKSSFP STVKNGLSKI GIPSNVLDFM 101: FDWTGSDQDY PKVPEAKGSI QAVRNEAFFI PLYELFLTYG GIFRLTFGPK SFLIVSDPSI AKHILKDNAK AYSKGILAEI LDFVMGKGLI PADGEIWRRR 201: RRAIVPALHQ KYVAAMISLF GEASDRLCQK LDAAALKGEE VEMESLFSRL TLDIIGKAVF NYDFDSLTND TGVIEAVYTV LREAEDRSVS PIPVWDIPIW 301: KDISPRQRKV ATSLKLINDT LDDLIATCKR MVEEEELQFH EEYMNERDPS ILHFLLASGD DVSSKQLRDD LMTMLIAGHE TSAAVLTWTF YLLTTEPSVV 401: AKLQEEVDSV IGDRFPTIQD MKKLKYTTRV MNESLRLYPQ PPVLIRRSID NDILGEYPIK RGEDIFISVW NLHRSPLHWD DAEKFNPERW PLDGPNPNET 501: NQNFSYLPFG GGPRKCIGDM FASFENVVAI AMLIRRFNFQ IAPGAPPVKM TTGATIHTTE GLKLTVTKRT KPLDIPSVPI LPMDTSRDEV SSALS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)