AT1G31230.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : aspartate kinase-homoserine dehydrogenase i | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a bifunctional aspartate kinase/homoserine dehydrogenase. These two activities catalyze the first and the third steps toward the synthesis of the essential amino acids threonine, isoleucine and methionine. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
aspartate kinase-homoserine dehydrogenase i (AK-HSDH I); FUNCTIONS IN: homoserine dehydrogenase activity, aspartate kinase activity; INVOLVED IN: aspartate family amino acid biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast stroma, chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aspartate/glutamate/uridylate kinase (InterPro:IPR001048), Homoserine dehydrogenase, catalytic (InterPro:IPR001342), Amino acid-binding ACT (InterPro:IPR002912), Aspartate/homoserine dehydrogenase, NAD-binding (InterPro:IPR005106), Aspartate kinase, conserved site (InterPro:IPR018042), Bifunctional aspartokinase/homoserine dehydrogenase I (InterPro:IPR011147), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040), Aspartate kinase domain (InterPro:IPR001341), Homoserine dehydrogenase, conserved site (InterPro:IPR019811); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: aspartate kinase-homoserine dehydrogenase ii (TAIR:AT4G19710.2); Has 17266 Blast hits to 16993 proteins in 2572 species: Archae - 397; Bacteria - 11403; Metazoa - 7; Fungi - 300; Plants - 257; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4902 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:11158744..11163055 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 99409.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.75 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 911 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPVVSLAKVV TSPAVAGDLA VRVPFIYGKR LVSNRVSFGK LRRRSCIGQC VRSELQSPRV LGSVTDLALD NSVENGHLPK GDSWAVHKFG GTCVGNSERI 101: KDVAAVVVKD DSERKLVVVS AMSKVTDMMY DLIHRAESRD DSYLSALSGV LEKHRATAVD LLDGDELSSF LARLNDDINN LKAMLRAIYI AGHATESFSD 201: FVVGHGELWS AQMLAAVVRK SGLDCTWMDA RDVLVVIPTS SNQVDPDFVE SEKRLEKWFT QNSAKIIIAT GFIASTPQNI PTTLKRDGSD FSAAIMSALF 301: RSHQLTIWTD VDGVYSADPR KVSEAVVLKT LSYQEAWEMS YFGANVLHPR TIIPVMKYDI PIVIRNIFNL SAPGTMICRQ IDDEDGFKLD APVKGFATID 401: NLALVNVEGT GMAGVPGTAS AIFSAVKEVG ANVIMISQAS SEHSVCFAVP EKEVKAVSEA LNSRFRQALA GGRLSQIEII PNCSILAAVG QKMASTPGVS 501: ATFFNALAKA NINIRAIAQG CSEFNITVVV KREDCIRALR AVHSRFYLSR TTLAVGIIGP GLIGGTLLDQ IRDQAAVLKE EFKIDLRVIG ITGSSKMLMS 601: ESGIDLSRWR ELMKEEGEKA DMEKFTQYVK GNHFIPNSVM VDCTADADIA SCYYDWLLRG IHVVTPNKKA NSGPLDQYLK IRDLQRKSYT HYFYEATVGA 701: GLPIISTLRG LLETGDKILR IEGIFSGTLS YLFNNFVGTR SFSEVVAEAK QAGFTEPDPR DDLSGTDVAR KVTILARESG LKLDLEGLPV QNLVPKPLQA 801: CASAEEFMEK LPQFDEELSK QREEAEAAGE VLRYVGVVDA VEKKGTVELK RYKKDHPFAQ LSGADNIIAF TTKRYKEQPL IVRGPGAGAQ VTAGGIFSDI 901: LRLAFYLGAP S |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)