AT1G31170.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : sulfiredoxin | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a cysteine-sulfinic acid reductase (sulfiredoxin - EC 1.8.98.2) capable of reducing overoxidized plastidic 2-Cys-Prx involved in peroxide detoxification and response to oxidative stress | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
sulfiredoxin (SRX); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sulfiredoxin (InterPro:IPR016692), ParB-like nuclease (InterPro:IPR003115); Has 313 Blast hits to 313 proteins in 133 species: Archae - 0; Bacteria - 130; Metazoa - 88; Fungi - 17; Plants - 42; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 34 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:11133521..11134228 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 13915.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.76 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 125 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MANLMMRLPI SLRSFSVSAS SSNGSPPVIG GSSGGVGPMI VELPLEKIRR PLMRTRSNDQ NKVKELMDSI RQIGLQVPID VIEVDGTYYG FSGCHRYEAH 101: QKLGLPTIRC KIRKGTKETL RHHLR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)