AT1G29280.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : WRKY DNA-binding protein 65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of WRKY Transcription Factor; Group II-e | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
WRKY DNA-binding protein 65 (WRKY65); FUNCTIONS IN: sequence-specific DNA binding transcription factor activity; INVOLVED IN: regulation of transcription, DNA-dependent, regulation of transcription; EXPRESSED IN: 8 plant structures; EXPRESSED DURING: LP.06 six leaves visible, LP.04 four leaves visible, 4 anthesis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: DNA-binding WRKY (InterPro:IPR003657); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: WRKY DNA-binding protein 69 (TAIR:AT3G58710.1); Has 3604 Blast hits to 3142 proteins in 247 species: Archae - 4; Bacteria - 64; Metazoa - 46; Fungi - 24; Plants - 3284; Viruses - 4; Other Eukaryotes - 178 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:10236589..10237467 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29055.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 259 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKRGLDMARS YNDHESSQET GPESPNSSTF NGMKALISSH SPKRSRRSVE KRVVNVPMKE MEGSRHKGDT TPPSDSWAWR KYGQKPIKGS PYPRGYYRCS 101: STKGCPARKQ VERSRDDPTM ILITYTSEHN HPWPLTSSTR NGPKPKPEPK PEPEPEVEPE AEEEDNKFMV LGRGIETTPS CVDEFAWFTE METTSSTILE 201: SPIFSSEKKT AVSGADDVAV FFPMGEEDES LFADLGELPE CSVVFRHRSS VVGSQVEIF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)