AT1G29080.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Papain family cysteine protease | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Papain family cysteine protease; FUNCTIONS IN: cysteine-type endopeptidase activity, cysteine-type peptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase C1A, papain (InterPro:IPR013128), Proteinase inhibitor I29, cathepsin propeptide (InterPro:IPR013201), Peptidase C1A, papain C-terminal (InterPro:IPR000668), Peptidase, cysteine peptidase active site (InterPro:IPR000169); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Cysteine proteinases superfamily protein (TAIR:AT1G29090.1); Has 7819 Blast hits to 7758 proteins in 724 species: Archae - 63; Bacteria - 249; Metazoa - 3289; Fungi - 4; Plants - 1890; Viruses - 133; Other Eukaryotes - 2191 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:10157494..10158674 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38787.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 346 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDFVEFVCVV LTIFFMDLKI SEATSRVALY KPSSIVDYHQ QWMIQFSRVY DDEFEKQLRL QVLTENLKFI ESFNNMGNQS YKLGVNEFTD WTKEEFLATY 101: TGLRGVNVTS PFEVVNETKP AWNWTVSDVL GTNKDWRNEG AVTPVKSQGE CGGCWAFSAI AAVEGLTKIA RGNLISLSEQ QLLDCTREQN NGCKGGTFVN 201: AFNYIIKHRG ISSENEYPYQ VKEGPCRSNA RPAILIRGFE NVPSNNERAL LEAVSRQPVA VAIDASEAGF VHYSGGVYNA RNCGTSVNHA VTLVGYGTSP 301: EGMKYWLAKN SWGKTWGENG YIRIRRDVEW PQGMCGVAQY ASYPVA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)