AT1G28960.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : nudix hydrolase homolog 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
nudix hydrolase homolog 15 (NUDX15); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NUDIX hydrolase domain-like (InterPro:IPR015797), NUDIX hydrolase domain (InterPro:IPR000086), NUDIX hydrolase, AtNUDT22 (InterPro:IPR017397); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nudix hydrolase homolog 22 (TAIR:AT2G33980.1); Has 3635 Blast hits to 3634 proteins in 1300 species: Archae - 59; Bacteria - 2277; Metazoa - 167; Fungi - 181; Plants - 103; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 848 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:10110135..10111607 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 32826.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 293 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MFLLYRRLPS FARTTTTTLL CKSMEPAITA TSSSSFGGGS SRLAALAQQL RQYKPPPSSS FDDSEEMQTD QETAGKVVSQ VGFQESIAPL SKDPDRFKPK 101: RAAVLICLFE GDDGDLRVIL TKRSSKLSTH SGEVSLPGGK AEEDDKDDGM TATREAEEEI GLDPSLVDVV TSLEPFLSKH LLRVIPVIGI LRDKNKFNPI 201: PNPGEVEAVF DAPLEMFLKD ENRRSEEREW MGEKYLIHYF DYRTGDKDYM IWGLTAGILI RAASVTYERP PAFIEQCPKF KYPKMVEKHT CMP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)